内陆航道、港口及大型疏浚工程项目众多，并形成了相应的施工工艺和机械设备。河道清淤公司针对围网治理过程中污水底泥的污染物去除问题，探讨了较多的“环保清淤”工程，即通过清理河湖底泥中的污染物，将河湖排出湖河的工程。环保清淤与工程化清淤的区别在于清淤底泥非常薄，大多数环保清淤底泥都是在20cm到40cm之间。所以，河道疏浚公司对设备定位、操作系统的要求很高。
富营养化河流正在清除富营养化的氮、磷营养物，实施大规模的环境保护清淤工程。为了提高城乡河道水质，开展了河道疏浚工作。城乡河道环保清淤工程与湖泊相比，可稍显宏大，由于河道自身的流动性和互换性，施工精度和二次污染要求都不高。目前环保清淤工程在处理淤泥时采用了堆场堆积的方式，排出的淤泥首先储存在堆场，将来在淤泥中进行土地恢复也许可以用来处理淤泥。
挖掘工程的主要目的是挖掘港池，清除淤泥，改善河流和湖泊的水环境，恢复生态环境，例如码头、港口和临港工业区、沿海城市用地和休闲娱乐用地、岸滩维护、水利防洪和水库清淤、改善河流和湖海的水环境，以及修建和填埋各种沟渠等。这对人类社会的进步，环境的改善，经济的发展都有着重大的意义。
在过去的二十多年里，人类对环境标准的要求越来越高，预防和减少疏浚活动对水域和陆地的污染已经成为疏浚工程中必须考虑的问题，而利用疏浚方法挖掘水下污染土壤，进行工程处理，也是疏浚工程中的一个重要内容。
中小河流工程量较小，这些前期工作很容易被忽视，而实际上，专业河道清淤先做一些前期工作就可以顺利实施，并且能够发挥预期的作用，对整个工程有很大的帮助。在前期工作的基础上，根据淤积量、大小、底泥性质和周围条件，确定主要工程环节的清淤、运沙、处理淤泥和尾水等技能方案，选择合适的清淤技能和施工设备，妥善处理处置淤泥，避免二次污染。近几年来，由于港口、航道、内河、湖泊的清淤工程众多，疏浚、清淤技术有了很大发展，装备水平有了很大提高，但能通到中小河流的专用船舶和设备还不多。
